Verificando se você já está com SSL ativo
Antes de qualquer coisa verifique se seu domínio não está com SSL ativo, para isso acesse seu site usando o protocolo HTTPS, digite no seu navegador https://seu_dominio_aqui.com
Se aparecer uma tela escrito que sua conexão não é privada é por que seu site está sem SSL
Se seu site carregar normal e com cadeado atrás do seu domínio é por que seu site está com SSL ativo, nesse caso você não precisa adicionar o certificado, porém pode ser que você queira forçar então pule para Forçar SSL
Adicionando certificado
Acesse seu painel de controle cpanel.
Vá até a sessão de segurança e procure por Lets Encrypt™ SSL
Procure pelo domínio que deseja adicionar o SSL e cliente em +Issue
Caso queira poderá adicionar ssl para os sub domínios como webmail, mail, cpanel etc. Basta marcar a caixa da coluna Add cPanel subdomains**?, lembrando que isso é opcional, se não quiser basta deixar a caixa desmarcada. Agora clique no botão Issue que está em alaranjado.
Após isso você devera receber a mensagem de sucesso.